微生物（活菌）在水產養殖中的作用，微生物在提高和實現池塘的生產力中起到主要的作用，沒有微生物的存在，池塘的生產力是無法實現的。在傳統的重慶水產養殖方法中，微生物依然是池塘生產力的主要體現者之一。土池底部的有機物和水體的有機物，是池塘第一生產力，其生產力的體現是通過微生物參加氮循環來實現的。傳統的水產，生產力的體現通俗說：把池塘底泥、水體中的氮變成魚蝦肉。這個轉化為魚蝦肉的過程，池塘的微生物起到重要的作用，沒有微生物的分解，很難實現這一步。但是我們一定要意識到；微生物在水體的物質循環中的作用是有極限的，我們人為的添加微生物也只能夠強化了這些轉化能力但不能無限度的增加這些轉化能力。同時池塘天然的生產力是會受池塘理化條件、氣候的影響。

影響微生物提高池塘生產力的因素，池塘的物理因素：這里包括氣候因素（溫度、光照）和水體的深度等等因素。太陽輻射決定了重慶水產養殖水體光合作用放氧量和呼吸作用耗氧量，水體的溶解氧濃度是微生物能夠進行有氧分解代謝的物質基礎，有充足的溶解氧，水體氮循環就可以良性進行，從而實現了生產力。水溫：決定了微生物狀態，太低的水溫，微生物很難進行代謝。水體深度：光照強度隨水深的增加而迅速遞減，水中浮游植物的光合作用及其產氧量也隨之減弱，至某一深度，浮游植物的光合作用產生的氧量恰好等于浮游生物呼吸作用的消耗量，此深度(m)即為補償深度，此點的輻照度為補償點（單位μE）。補償深度以上的水層稱為增氧層，以下的水層稱為耗氧層。在人工增氧條件不足的池塘，太高的水位也帶來了一定的負面影響。

生物因素，藻類就是池塘中的生產者，這些浮游藻類的種類和數量也決定了池塘的生產力。以鞭毛藻和以甲藻為優勢種的水體，是一種不利于養殖的種群。藻若繁殖過剩，發生藻敗，引起水質和底質變壞，造成對蝦發病和死亡。  池塘中浮游植物的數量和繁殖速率是決定池塘產量的一個重要條件。

池塘化學因素，鹽度，這個主要是決定養殖水的滲透壓及養殖品種對滲透壓的調節能力，這里不提。pH與二氧化碳平衡體系，水中CO2—HCO3-—CO32-及Ca2+—CaCO3是兩個重要的緩沖系統，對養殖水的pH值的具體數值與穩定性有決定性的影響。這里也不提。溶解氣體：DO/NH3/H2S，池塘中溶解氧的消耗主要是水中浮游生物、細菌和水中有機物氧化分解，亦稱“水呼吸”，一般可占水中溶解氧總支出的70%左右；池底淤泥中有機物分解也要消耗大量的氧氣，而養殖對象消耗氧氣的比率很低。 足夠的溶解氧是維持浮游生物、細菌和水中有機物氧化分解的必要條件，也就是我們能不能有活菌的必須條件。

營養鹽，浮游植物生長繁殖所需從環境中索取的物質統稱為營養鹽類，包括氮、磷、鉀、鈉、硅、鈣、鐵、碳及微量的錳、鋅、銅、鈷、鋅、鎂、鉬等。其中氮、磷的含量是決定池塘生產力高低的一個重要條件。

這一條也不提了。隨著我們的養殖產量的提高，隨著我們外來水源的污染嚴重、底泥的有機物的不斷積累，微生物對底改的作用就只能被置于次要的位置了甚至有時候一定要把微生物的活動（也就是我們說的生物底改）停下來才能保證我們的水質。把微生物的活動（也就是我們說的生物底改）停下來具體做法就是：消毒！