在現在以投餌為主的養殖模式下，殘餌、糞便、N、P等富營養因子排入水體，使養殖水體中化學需要量（COD），生物耗氧量（BOD）嚴重超標，有的已超過三類水質標準。據估計每生產一噸蝦可水體中增加0.2噸的N無素和0.05噸的P元素，其結果是導致魚蝦病害和產量的瓶頸。因此改善水產養殖水域環境已成為養殖業生產中可持續發展的關鍵技術和研究熱點。

眾所周知，水產環境中化學藥品的使用會造成病原體產生抗藥性，藥品的殘留量，污染水環境，同時會殺害水中有益細菌，造成水生生態的失調。很快有學者提出對魚蝦用藥是暫時的手段，生態防治才是出路，而微生物作為一種生態調節劑，治理養殖水環境可以明顯改善水質，增加溶氧，降低氨氮與亞硝酸氮，抑制有害微生物的繁殖，降解有機物，同時具有成本低收效大等優點而日益受到重視。

生物恢復是利用微生物(細菌，真菌，酵母菌或提取物)對環境污染物的吸收，代謝，降解等功能，在環境中對污染物的降解起催化作用，從而去除或消除環境污染的一個受控或自發的過程。    

目前，生物恢復技術劃分為原位恢復和異位恢復兩種。所謂原位恢復是指對受污染的介質(土壤，水體)不作搬運或輸送而在原位污染地進行的生物恢復處理，其恢復過程主要依賴被污染地土著微生物的作用，需要引入一些外來微生物，利用微生物的代謝作用，將環境中的污染物降解到不對環境產生影響。異位恢復是指將被污染介質(土壤，水體)搬運或輸送到別處進行的生物恢復處理。前者主要用水域，耕地的環境恢復，后者主要用于工業和生活污水的處理。

微生物是自然界分布廣，種類多，數量大，個體小的生物類群，是大自然生態平衡的基礎。這些微生物直接或間接地作用水產養殖對象和養殖環境，很好地分解養殖生物排泄物，殘餌以及浮游植物殘體等有機物，凈化了環境，同時微生物鏈在水質凈化中通過氧化，還原，光合，同化，異化把有機物轉變為簡單的化合物，保證水質的正常功能，從而維持水生生態系統中水生生物，病原，水質間的平衡。