淡水水產養殖中的常見藻類大致分為：藍藻門、裸藻門、金藻門、甲藻門、隱藻門、硅藻門、綠藻門、黃藻門等。藍藻、微囊藻（死亡后產生的毒素更大，抑制其它藻類生長）；螺旋藻（不易消化）、顫藻（不易消化）、平裂藻、項圈藻、魚腥藻、微囊藻（易產生水華）。其中有的是有益藻類，則有的是有害藻。
 

        藍藻的習性
藍藻的發生很大程度上取決于溫度。藍藻繁殖時對溫度敏感，水溫在17℃以下時，不會大量發生，或者不會對魚類構成危害。當水溫上升到28℃時，由于其它藻類的生長受到抑制，同時又大量被魚類吞食(溫度高魚類攝食代謝增強)，藍藻很容易形成優勢種群而大量爆發。

1.pH值：
藻類喜歡偏堿性的水體，高pH(pH8.0~pH9.5)會促進藍藻的發生，故應避免單一使用潑灑石灰水的方法改善水質。
 
        2.氮磷比：
藍藻既可利用水體中的氮，又具有更高的利用磷的能力，低氮磷比或含磷較高富營養化的水體都可能導致藍藻的大量發生。適當提高氮磷比可在一定程度上抑制的藍藻的生長。

3.生態關系：
藍藻與其它藻類一起構成重慶水產養殖中池塘生態系統的生產者，提供了89%以上的溶氧。因此這些生產者除了參與生態系統的物質循環外，還影響到魚類的生存。
 
        4.藍藻水華的成因：
不同階段的關鍵因素不同，一般可以將藍藻水華的形成分為四個階段：休眠、復蘇、生物量增加、上浮。上浮后形成藍藻水華，然后開始出現轉水。

5.藍藻的危害：
藍藻可以改變膨壓，在高溫強光照的天氣情況下，聚集在水體表層，吸收了大部分的陽光，在自己大量繁殖的同時抑制其它藻類的生長。藍藻的大量繁殖，不斷向水體分泌有毒代謝物質，從而影響浮游生物的種群演替、繁殖周期，還可引起一些浮游動物的大量死亡。

藍藻大量發生的危害

藍藻顆粒很難被魚類消化，大量繁殖后很快就會成為絕對優勢種群。這種通過種空間競爭形成的過度繁殖，必然也會帶來種內斗爭，這種內斗的結果又將導致大量的藍藻死亡。藍藻的大量死亡使得水體的生產者銳減，造成水體中的溶氧供應嚴重不足。同時，藍藻死亡分解也會消耗大量的溶氧，釋放大量羥胺、硫化氫等有毒物質。在嚴重缺氧和有毒物質存的條件下，魚、蝦、蟹類會大量死亡，甚至全部死亡。
 
控制藍藻的方法
 
        1.徹底清塘消毒，加注不帶藍藻的新鮮水：
由于藍藻比其它藻類具有更強的競爭力，因此控制措施以預防為主、防重于治。徹底清塘消毒可有效殺滅藍藻、降低基數，可減少大規模發生的可能。同時應注意避免隨加水帶入藍藻，對控制藍藻也有積極意義。

2.定期換鮮水：
對于含有較多藍藻的池塘，經常大量地換新鮮水，可稀釋藍藻的濃度。同時也稀釋了藍藻分泌的毒物濃度，促進其它藻類的生長和保持整個生態系統的動態平衡。當藍藻大量發生時，可選用爭躍殺藻藥物局部殺藻，三天后重新培養藻類。

3.放養一定數量的濾食性魚類：
雖然藍藻不易被消化，但由于其顆粒較大，更容易被濾食性魚類攝食到體內，在一定程度上延緩、阻礙了藍藻的生長。可供選擇的魚類有白鰱、花鰱、白鯽等。實踐表明放養一定數量的濾食性魚類時，基本不會爆發藍藻。

裸藻

1.裸藻的發生產生裸藻水華的水環境：
裸藻喜生長在有機質豐富、靜止無流水的小水體中，并在營養充足時大量繁殖形成水華，成為水體中優勢種迅速占領整個水表面。
 
         2.水華形成的適宜溫度和季節：
裸藻適宜生存的溫度范圍較廣。水華形成的適宜溫度為20～35℃，生長期橫跨春、夏、秋三個季節，尤以6、7、8、9月份生長Z旺盛。

3.裸藻的危害：
裸藻難消化，利用率低，魚類不喜攝食；裸藻大量死亡時容易敗壞水質，分泌的物質還對魚、蝦、蟹類產生毒害作用。

4.裸藻的防治：
大量換水，使水體形成微流水。由于裸藻喜在有機質豐富、靜止無流水的小水體生活，大量換水能改變這種環境，使得裸藻不易在流水中或新水中繁殖。也可以用殺藻藥物進行局部殺藻，三天后用漁肥進行肥水，有良好的效果。
 
金藻、三毛金藻

1.三毛金藻的發生：
主要發生在沿海鹽堿地區鹽堿度較高的池塘。發病池水質清瘦，水中沒有別的藻類，水色為淡黃色。

2.三毛金藻中毒的癥狀：
池面上布滿魚類，大多停留在四角及淺水池邊，頭朝岸邊、排列整齊、在水面下靜止不動、也不浮頭，受到驚擾也無反應。隨機撈取瀕臨死亡的白鰱、鯽魚觀察，可發現體表鰭基部充血，魚體后部顏色變淺；打開鰓蓋發現鰓內有大量粘液，鰓絲輕度腐爛；解剖魚體，腸道無食，無明顯病灶。

3.三毛金藻的防治：
向池內注入水質較肥的河水或臨近池塘的肥水，中毒癥狀可暫時得到緩解。全池潑灑20g/m3的硫酸銨，使水中的氨離子達 0.06～0.10g/m3，以抑制或殺死三毛金藻。

甲藻、裸甲藻、飛燕角甲藻

甲藻喜歡生長在有機物質多、硬度大、微堿性的水體中。它們大理繁殖時，水呈紅棕色俗稱“紅水”。

甲藻的危害：甲藻為一大類鞭毛藻的總稱，體呈卵圓形，大量繁殖時，常可改變其生活水域的顏色，有些甲藻可以作為某些水產幼體的餌料，但其中有些類群，在繁殖過程中，可產生多種毒素，引起魚類的神經麻木，代謝失調及呼吸障礙，Z后導致死亡。卵甲藻還能附在魚身上，過寄生生活，吸收魚體養料，刺激魚體增生粘液，使魚體像涂了一層米粉似的，故稱“打粉病”，甲藻的防控同藍藻。
 
隱藻

隱藻的優點隱藻是天然水域中Z重要的鞭毛藻之一，隱藻含量豐富的水塘具有很高的生產力。隱藻的蛋白質含量較高(50%～70% )，而且某些種類，如卵形隱藻(Cryptom onas ovata)還含有較為豐富的不飽和脂肪酸，特別是具有較高營養價值的GLA (十八碳三烯酸)和EPA (二十碳五烯酸)，它們分別占總脂肪酸含量的20%、16%和4%。隱藻有較高的營養價值，加之其無纖維素的細胞壁極易被消化吸收。因而，是魚類及某些珍貴重慶水產養殖動物的優質餌料之一。

隱藻的缺點：隱藻的生長周期較短，容易發死亡，水色為灰褐色。

硅藻：小環藻、舟形藻、直鏈藻、羽紋藻

硅藻的優點是：
個體小，適口性好。運動速度及分布情況與幼體活動習性一致，便于攝食，即攝食的機會更多。營養豐富且易于消化吸收，本身及其代謝產物無毒,，不影響幼體、苗種的正常生長。有利于優良浮游單細胞藻類繁殖，保障魚、蝦的營養充足，確保魚、蝦苗吃飽長快，增強抗病力和提高成活率。高效、無殘留，保護養殖環境，穩定水質，不污染池塘。有效降低水中氨氮含量，溶氧度高，水色好。

綠藻：

綠藻：盤星藻、新月藻、柵藻衣藻、空球藻、空星藻、實球藻、水網藻（對魚苗有害）、水綿（水體清瘦絲狀藻類）、微芒藻。

1.綠藻的應用：
由于綠球藻具有易培養、細胞壁薄、營養豐富等特點，目前主要作為餌料應用于水產養殖業中。

2.綠藻的優缺點：
在我們池塘養殖中大量生長的多為小球藻，因其個體較小，營養豐富，是輪蟲的優良鉺料。能夠使水體中產生大量輪蟲，較為適合魚、蝦、蟹幼苗的培育。可直接作為水產幼苗的開口餌料，也可培育輪蟲用來喂養幼苗；但由于其個體較小，養殖的成品魚類對其的利用率不高，可作為調水產品來使用。

黃藻、膝口藻

黃藻、膝口藻在溫暖的季節，常出現于肥沃的魚池水體中。大量繁殖時，形成云彩狀水華，水色呈黃綠色。是鰱、鳙魚的好餌料。冬季初級生產力集中在溫帶中或富營養型湖泊中；冬季在低光照、短日照和低溫下，浮游植物生產力和生物量一般較低。當水面封冰時，如果冰層不厚且無積雪復蓋，冰下的光照度通常遠高于藻類的補償點，光合作用仍可不同程度地進行著。當冰層由厚的烏冰組成或冰上長期覆雪時，凈產量轉為負值，由于冰下無湍流藻類易下沉，生物量降到Z低點。

冰下浮游植物主要由隱藻、甲藻、金藻等鞭毛藻類組成。

春季首先是硅藻種群的大量增長。硅藻高峰期一般不超過3個月，此后由于硅酸鹽枯竭(＜0.5mg/L)或其他原因(動物濾食、菌類寄生等)，種群開始消退并為綠球藻類或某些甲藻所取代。這段時期如果生產層的養分能及時得到補充，生產力仍然很高。

夏、秋季節隨著綠藻的發展，水中含氮量降到極低點，因而仲夏以后固氮藍藻(魚腥藻、束絲藻等）取代綠藻而急劇增長。藍藻此時占優勢的原因還與高溫度(25℃以上)、強光照、高pH值以及較少被采食等有關。藍藻水華期生物量很高，但生產力通常下降。

秋后光照的減弱和溫度下降等原因，會引起藍藻種群突然性地消退。

此后，隨著秋季水層的垂直混合，環境條件又和春季類似，因而出現了硅藻的第二次高峰。